Además del rifle sanitario de los animales infectados, en décadas de experiencia en América del Sur, las vacunas de fiebre aftosa han sido un componente del control de la enfermedad desde el inicio de los programas nacionales en los años 60. Su papel en la mejora de la situación sanitaria de las zonas y países es innegable.

Los estudios epidemiológicos desarrollados por PANAFTOSA en coordinación con los países llevaron a la identificación de los ecosistemas de la fiebre aftosa. Los estudios han servido de base para el establecimiento de estrategias de lucha contra la enfermedad. Finalmente, como resultado de este enfoque, varios países de América del Sur alcanzaron  el reconocimiento internacional de zonas o países libres de fiebre aftosa con y sin vacunación.