Los principales proyectos adelantados en OPS COLOMBIA (2008-2009) son:

Convenio OPS/OMS – Gobernación de San Andrés (Proyecto San Andrés Saludable - Fase II)
Antecedentes: La Fase I fue una iniciativa de autoridad local que gestionó recursos ante la OMS, para un proyecto piloto, inscrito dentro de: “Minimización de los factores de riesgo de enfermar por dengue y enfermedades de origen hídrico en San Andrés Isla, 2005 -2006”, alcanzando los siguientes productos:
- Conformación Comité Interinstitucional Nacional y Local.
- Análisis y diagnóstico institucional (ETV, Servicios básicos).
- Estudio diagnóstico sobre factores de riesgo socioculturales y ambientales prevalentes para la transmisión de las ETV y gastrointestinales de origen hídrico.
- Proyecto piloto demostrativo en vivienda mejorada (Vivienda Saludable).
- Formulación del perfil del proyecto Fase II

Para la fase II se firma el 31 de diciembre de 2007, un Convenio de Cooperación Técnica, Administrativa y Financiera con la Gobernación de San Andrés.

Objetivo del Convenio: Contribuir a la reducción de la carga socioeconómica y de la morbi - mortalidad causada por dengue, roedores y enfermedades de origen hídrico en el Departamento Archipiélago de San Andrés, para mejorar la salud y calidad de vida de la población y propiciar que sea un Departamento Saludable.

Proyecto Interagencial del Sistema de Naciones Unidas “Integración de Ecosistemas y Adaptación al Cambio Climático en el Macizo Colombiano”

Agencias involucradas: PNUD, FAO, UNICEF, OPS
Socios Nacionales: Ministerio de Medio Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial, Instituto de Estudios Ambientales, Corporación Autónoma Regional del Cauca, Departamento Nacional de Planeación.
Objetivo del Proyecto: Consolidar la capacidad nacional y regional para el conocimiento, conservación y uso sostenible de la biodiversidad y la preservación, manejo y restauración de los ecosistemas para garantizar el mantenimiento de los bienes y servicios ambientales, incorporando consideraciones de adaptación al cambio climático.