Para o alcance dos objetivos e resultados esperados, a OPAS/OMS no Brasil atua em quatro Programas/Projetos que são gerenciados pelas Unidades Técnicas, assim organizadas:

Desenvolvimento Integral da Representação

• Gestão Baseada em Resultados
• Gestão Baseada na Eficiência/Transparência Administrativa
• Gestão do Conhecimento e Comunicação
• Programa de Cooperação Internacional em Saúde
  

• Serviços de Saúde
• Política de Recursos Humanos em Saúde
• Medicamentos, Tecnologia e Pesquisa

Prevenção e Controle de Doenças e Desenvolvimento Sustentável

• Doenças Transmissíveis e Não-Transmissíveis
• Desenvolvimento Sustentável e Saúde Ambiental
• Vigilância, Informação e Análise de Saúde

Saúde Familiar e Ciclo de Vida 

• Saúde Familiar
• Saude da Mulher, do Homem, Genero e Diversidade Cultural